2020年9月14日，臺北市大同區寧夏路35號，蓬萊國小校門。（張哲生 攝）
臺北市蓬萊國小的歷史要從120多年前的臺灣日治時期說起。
1898年，大稻埕公學校女子部成立於大稻埕公學校（今臺北市太平國小）內，成立之初只有兩名學生，之後學生逐年增加。
1910年4月1日，大稻埕公學校女子分教場（分校）成立。
1911年4月1日，自大稻埕公學校獨立創設為「大稻埕女子公學校」，並舉行開校典禮，首位校長為樺山兒見。
1912年4月1日，第二任校長上滿常吉上任，第一屆畢業生畢業（學生8名）。
1914年4月1日，第三任校長本田茂吉上任。
1914年6月3日，現址校舍落成，有學級6班、學生283名、教員7名。第四任校長櫻井馨上任。
1922年4月，改名為「蓬萊公學校」，專收女生。
1924年4月，第五任校長中野勝馬上任。
1926年4月，設置女子高等科（戰後廢止）。
1928年4月，高等科第一屆畢業。第六任校長下川高次郎就任。
1941年4月，校名改為「蓬萊國民學校」，第七任校長永友秀夫就任。
1945年11月15日，郭漢滄先生奉令接任校長，為戰後第一任校長。
1946年3月5日，廢止高等科。
1948年10月，重建之禮堂落成。
1952年1月，林清南先生接任校長。
1954年5月，臺北市國小乒乓球三年連勝冠軍杯永久保存。
1956年8月，開始兼收男生。
1957年11月，陳臣火先生接任校長。
1964年10月20日，陳錫福先生接任校長
1966年，校舍三樓屋頂增設水塔。
1968年8月，實施九年國教，校名改為「臺北市建成區蓬萊國民小學」。
1969年11月，校內增設牙科治療室。
1972年9月1日，蘇松林先生接任校長。
1973年，2月成立兒童管樂隊。8月成立兒童弦樂隊。獲臺灣區民族舞蹈比賽第一名。
1974年3月，舉行全市性國民小學健康教育觀摩會。
1975年7月，於臺北中山堂舉行第一次管弦樂演奏。
1979年2月15日，孟繁祚先生接任校長。
1984年，西面紅磚教室拆除。
1985年，南面紅磚教室拆除。
1986年，行政大樓竣工啟用。黃清一先生接任校長
1987年，專科教室竣工，北面紅磚教室及禮堂拆除。
1988年，PU運動場竣工，幼稚園成立。
1990年，舉行建校八十年慶祝活動；3月12日配合行政區域調整，更名為「臺北市大同區蓬萊國民小學」。
2003年7月，新校門落成。
2003年8月，吳宗哲先生接任校長。
2011年6月14日，陳培章先生接任校長。
2011年12月5日，校舍整體擴建第2期工程完工啟用。
2014年3月28日，雲端學習中心啟用。
2017年8月1日，尚漢鼎先生接任校長。
2018年12月8日，超能教室（X-Lab）啟用。超能教室乃結合智高積木、智慧機器人，及程式教育光速球等數位科技，以STEAM的教育理念作為主軸，落實在正式課程中；學校教學團隊特別提煉「超能教學模式」，以洞察問題、演算規律、歸納設計及解析分享等4種策略步驟，引導學生學習與進行小組合作，打造蓬萊STEAM校訂課程，希望讓學生有機會跨域增能發揮創意，培育科學、科技、工程、藝術及數學的各項素養能力。
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