在高雄農業改良場黃德昌場長的FB
https://www.facebook.com/tzechung.huang
可以看到農友提供一張照片，請場長幫忙診斷，
而桃園區農改場葉俊巖博士診斷─「用厨餘或動物排泄物製作堆肥，醱酵不足，幾乎必定發生，不限於空心菜，所有作物都會! 我還在八里碰過一位强調自製有機肥的農民，他的文旦基部及低垂的葉片上也出現這類症狀，那次培養的結果是 Pilobolous,屬於糞生菌類!」
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有許多的農友也遇過類似的問題，在許多農民日漸開始使用自製有機質肥料後，這種問題也越來越多。
而糞生菌多，會有什麼影響呢？目前糞生菌是否會產生毒素，目前並沒有很明確的機制，這是一個還需要研究的領域。
但這也可以推論，肥料中雜菌多，萬一肥料裡面有出血性的大腸桿菌存活，作物就可能受到汙染，如果又直接生吃，那後果真的頗嚴重，但有機耕作不就最喜歡強調生吃嗎？
一般市面上買的到的有機質肥料分為生肥跟熟肥，生肥就是指未發酵的農業廢棄物，一般以油粕類為主，例如黃豆渣、芝麻粕、苦茶粕以及最廣為農民使用的蓖麻粕，這些生肥在田裡使用會放出熱量、產生氨氣、消耗熱量等產生對植物生長不利的因素，因此植物成長時，不適合使用生肥。
那生肥甚麼時候用呢？就是兩期耕作中間，使用生肥，在土壤裡發酵以改善地力，也就是一般所謂的基肥使用。
而熟肥就是指生肥經過發酵後的產物，施用後不會再發酵產生其他不良的影響。
但以一般的豆粕而言，生肥的成分是NPK氮磷鉀6-2-2左右，如果發酵成熟肥後可能只剩4-1-1造成肥份的流失。
生肥肥份高，又可以透過發酵放出一些有益植物的有機化合物，因此有些農民喜歡使用生肥，長的很明顯，卻忽略了生肥的壞處，忽略直接使用生肥帶來植物的損害。
在肥料要覽裡面，可以看到林財旺副研究員製作的堆肥生產流程。
堆肥是一種專業，不是把廢棄物全部加在一起，然後放著堆肥就可以完成。
堆肥的步驟可以分為以下的步驟:
1. 調整C/N ratio 碳氮比，微生物生長時需要消耗碳與氮，因此如果錯誤的碳氮比，微生物將難以生長，無法進行發酵，而C/N值也會受到你選用的有機質肥料所影響，一般的禽畜類的有機質C/N控制在20~30左右，所以需要進行調整。
2. 水分調整，微生物的繁殖最適合的溼度約為重量百分比的60~65%，怎麼判斷濕度夠，就是空手緊握肥料水會慢慢滲出，而不是滴下，要準確有兩個方法，一個用烘箱110度6個小時後秤前後重量差，另一個是使用紅外線水分偵測儀，快又簡單，一台20萬。
3. 菌種添加，如果不添加，你營造好的環境，空氣中的微生物還是能協助發酵，添加自然會比較快，而且可以控制發酵後的成品，這是很平常的地方，但現在卻被炒作成EM菌，甚麼是EM菌，EM就是Effective Microorganisms，認真來說應該是有益的微生物，就是光合菌、酵母菌、乳酸菌、放線菌等眾多的微生物組成的複合菌群，一般堆肥用的就是放線菌或木黴菌為主的主菌群。
4. 通氣、翻堆，有多的人力就做，沒有就把肥料堆成錐狀，是發酵比較有效率的方式，投入的資源多，可以減少發酵時間。
發酵完成後就得到堆肥了。
堆肥到底要發酵多久才能完成，堆肥受到以上因素控制，加上發酵時的氣候溫度、濕度影響，自然不會有一個標準時間。
但要怎麼了解自製的堆肥是否發酵完成呢？
就要看兩個因素，溫度跟濕度。
發酵的過程之中會生產熱，會讓溫度維持到60~70度之間，這時候因為高溫，主要的菌群是放線菌為主，到整個熟腐完成，溫度就會慢慢下降，微生物也會減少，一個好的堆肥，正常的菌群約在10四次方 cfu/g，所以如果一個好的堆肥一直跟你強調菌數很高、菌很多，就代表他根本不懂什麼是好的堆肥。
所以最後溫度下降至20度左右，濕度到20左右，就是一個良好的堆肥。
而一般農民習慣使用的簡易錐狀堆肥，如果在1.5米高左右的錐狀堆肥、碳氮比良好、水分良好的情況、菌種添加、20天翻堆一次，約要2個月的時間，可以完成熟腐。
堆肥絕對不是廢棄物加一加，EM菌粉加一加，很快就可以使用的物質。
肥料也是一種專業，只是太多人都不把肥料當專業，就跟有機一樣，有機也是一種專業，但太多人弄的不像專業而像宗教，推動小朋友生食有機農產品，就遠遠缺乏食品安全的概念，也傷害了有機的專業。
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